Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms