Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPLO60437 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPLO60437 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPLO60437 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPLO60437 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPLO60437 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPLO60437 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPLO60437 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPLO60437 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPLO60437 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPLO60437 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPLO60437 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPLO60437 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPLO60437 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPLO60437 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPLO60437 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPLO60437 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPLO60437 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms