Protein–RNA interactions for Protein: O43543

XRCC2, DNA repair protein XRCC2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC2O43543 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XRCC2O43543 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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