Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2SURPO15042 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2SURPO15042 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms