Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms