Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms