Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TTLL13PA6NNM8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms