Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNPO3Q9Y5L0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms