Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A8Q9Y2E8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms