Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRPF3Q9ULD4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms