Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms