Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPNE7Q9UBL6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms