Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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HOXC10Q9NYD6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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HOXC10Q9NYD6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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HOXC10Q9NYD6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC10Q9NYD6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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