Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
XKR8Q9H6D3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms