Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLMPQ9H6B4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLMPQ9H6B4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLMPQ9H6B4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLMPQ9H6B4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLMPQ9H6B4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLMPQ9H6B4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLMPQ9H6B4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLMPQ9H6B4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLMPQ9H6B4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLMPQ9H6B4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms