Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms