Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
YTHDF1Q9BYJ9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms