Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC4A5Q9BY07 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms