Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARD11Q9BXL7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms