Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLVAPQ9BX97 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms