Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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