Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC11Q9BVV2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms