Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MCMBPQ9BTE3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms