Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LYSTQ99698 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms