Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms