Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms