Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGAM5Q96HS1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGAM5Q96HS1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGAM5Q96HS1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGAM5Q96HS1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGAM5Q96HS1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM5Q96HS1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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