Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM12Q96EX1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms