Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NXPE2Q96DL1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXPE2Q96DL1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms