Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms