Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms