Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF248Q8NDW4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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