Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms