Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF182Q8N6D2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms