Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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TRAPPC6BQ86SZ2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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TRAPPC6BQ86SZ2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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TRAPPC6BQ86SZ2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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TRAPPC6BQ86SZ2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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TRAPPC6BQ86SZ2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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TRAPPC6BQ86SZ2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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TRAPPC6BQ86SZ2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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