Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT28Q7Z3Y7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms