Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HECW1Q76N89 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms