Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFVQ71UI9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2AFVQ71UI9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2AFVQ71UI9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2AFVQ71UI9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2AFVQ71UI9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2AFVQ71UI9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2AFVQ71UI9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2AFVQ71UI9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2AFVQ71UI9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2AFVQ71UI9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2AFVQ71UI9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2AFVQ71UI9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2AFVQ71UI9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2AFVQ71UI9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2AFVQ71UI9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2AFVQ71UI9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms