Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms