Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms