Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms