Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms