Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PERM1Q5SV97 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms