Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms