Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms