Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms