Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSM3Q53FZ2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms