Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SP6Q3SY56 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SP6Q3SY56 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SP6Q3SY56 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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