Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms