Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms